Von "Pendlerpauschale" steht in dem Link rein gar nichts.
Für Dich fett hervorgehoben:
Welche Kosten spielen eine Rolle für die Lohnsteuer-Ermäßigung?
Für den Antrag auf Lohnsteuer-Ermäßigung spielen die gleichen Ausgaben eine Rolle wie für Deine Steuererklärung. So kannst Du Dir zum Beispiel einen Lohnsteuerfreibetrag für die Werbungskosten aus Deiner Arbeitnehmertätigkeit, für Sonderausgaben oder für außergewöhnliche Belastungen eintragen lassen.
Was Werbungskosten sind, wird von hier erklärt. TL;DR: Fahrtkosten können in Form der Entfernungspauschale als Werbungskosten geltend gemacht werden.