also - ifa auf jedendfall mal weglassen, denn der weg dahin, kurz durchlaufen und zurück kann schon etwas mehr als drei stunden werden...
aber sonst waren hier gute vorschläge dabei
nun ich - ich empfehle folgendes: 
start
lehrter - sbahn zum kudamm - zoo austeigen - den kudamm richtung wittenbergplatz, also kadewe, lang laufen. hast du etw. von DER einkaufstrasse gesehen.
dort steigst du in den m29 und fährst damit entweder potsdamer brücke [neue national gallerie] und läuffst da richtung potsdamer platzt oder du fährst erstmal bis kochstrasse, um checkpoint charlie zu sehen.
tour1 - zuerst potsdamer platz
dahinlaufen, sich umschauen und geniessen. dann mit der seitenstrasse richtung anhalter bahnhof laufen und dort vllt. sich kurz ins cafe solar setzen [wurde schon empfohlen; richtig cool dort und schöne aussicht und vorallem weniger warteschlange als am turm auf dem alex - nämlich keine :D]. dort sind auch übrigens arcor-hotels [falls man doch länger bleiben will...wegen der ausstellung "versunkene schätze ägyptens" zb.]. topographie des terrors, stück berliner mauer, abgeordneten haus und die ausstellung befinden sich alle hier in der umgebung. kanns diese sogar noch vor dem cafe kurz anschauen. von dort sind es max. 10min und du bist...
...checkpointcharlie.
hier kurz umschauen und dann schnell die friedrichstrasse hoch - was zu sehen war, wurde erwähnt - lohnt sich...am showroom, also an der ecke unter den linden/freidrichstrasse kansnt du dir überlgen, was du amchen willst kurz den bahnhof friedrichstrasse anschauen? und dann der spree entlang zum reichstag/brandenburger tor gehen? oder doch lieber unter den linden lang laufen und dierekt beim brandenburger tor landen? [in der nähe: das jüdische mahnmal]...
von dort gehst du dann am reichstag und kanzleramt in ruhe zum hauptbahnhof zurück 
tour2 - zuerst checkpint charlie:
wie schon beschrieben, die friedrichstrasse hoch laufen und alles anschauen. an der ecke unter den linden/friedrichstrasse die entscheidung treffen: entlang der spree laufen oder die strasse entlang? brandenburger tor/reichstag anschauen und dann über das mahnmal richtung potsdamer paltz laufen. dort umschauen und sich dann noch in richtung topographie des terrors bewegen. vllt. schaffst du anhalter bahnhof noch kurz das cafe zu geniessen...würde aber da die mauer vorziehen
- nun läufst du zurück richtung brandenburger tor, am reichstag vorbei und siest wieder den hauptbahnhof...
[etwas kürzer als tour1 beschrieben, ist aber mehr oder weniger das selbe
etw. andere reihenfolge...]
ich empfehle aber eh tour 1, weil ihr da weniger hin und her laufen müsst, sondern quasi eine richtung vorgegeben habt - einmal umkehren wäre drinn, falls ihr euch dort im cafe hinsetzt - das ist etwas weiter weg von der mauer&co - etw. abseits - aber sind nur paar minuten
und von daher zu verkraften...letzteres entscheidet eh eure kaufsucht und euer lauftempo 
viel spass
ciao