Persönlich habe ich in den einzelnen Outlook-Installationen jeweils einen Unterordner mit lokalen Kontakten angelegt, den ich bei der Synchronisation ausgenommen habe.
Ob das auch in anderer Richtung geht (also in WindowsPhone) weiß ich zwar nicht konkret, ich kann mir aber durchaus vorstellen, dass diese Möglichkeit auch bei WP besteht.